红底黄月水波纹旗是招商局的第四面局旗。1937年，抗日战争爆发，因红底黄月旗与日敌旗相似，所以从1942年起将其更换为红底黄月水波纹旗。1951年2月1日，招商局内地部分更名为“中国人民轮船总公司”，红底黄月水波纹旗在内地停止使用。但1949年迁往台湾的招商局机构一直沿用该旗，直至1995年。